Em toda minha experiência com vidrarias de Química e Biologia, sempre nos foi ensinado que é pra lavar com água e detergente, passando bastante água depois.
Acredito que a limpeza de materiais para esses fins exija muito mais cuidados do que pra degustação de cerveja, então não vejo problema em lavar copos com detergente comum, tendo em vista que nenhum vidro de ácido explodiu na minha mão ou alguma peça de sódio explodiu o lab inteiro.
