Kra eu uso os dois.
O BjCP é clássico, para estilos tradicionais é ótimo, mas ainda tem muita coisa que não tem nele, o BA tem os estilos mais recentes, então para entender essa enxurrada de cervejas novas no mercado principalmente da nova escola norte americana é o mais indicado.
Pelo que comentaram aqui no fó rum já, o BJCP tem uma atualização de tempos em tempos (se não me engano 4 ou 5 anos) e parece que tem uma por vir, e eles se atualizam com novos estilos e coisa e tal, nessa próxima deve entrar muita coisa que hoje é specialty como a Quadrupel.
Já o BA pelo pouco que eu sei, não tem dessa ele se atualiza quando acha interessante.
Mas para consulta é sempre legal ler os dois, ver as diferenças de pensamento, aprende-se bastante.